มูลนิธิชุมชนเกษตรนิเวศน์ เริ่มก่อตั้งมาจาก โครงการเสริมประสิทธิภาพเกษตรสุรินทร์ โดยดำเนินการมาตั้งแต่ปี 2530 เป็นต้นมา โดยทำงานเพื่อสร้างรูปธรรมของการผลิตแบบเกษตรอินทรีย์แบบครบวงจรทั้งการผลิตและการจำหน่ายเพื่อให้เกษตรกรสามารถบริหารจัดการและแก้ปัญหาพื้นฐานของตนเองได้ พร้อมทั้งการสร้างความเข้าใจกับกลุ่มผู้บริโภคให้เห็นความสำคัญแก่การบริโภคผลผลิตที่ดีต่อสุขภาพ โดยเป็นโครงการพัฒนาชนบทที่มิได้หวังผลกำไร